五月十四日午后，清军先锋数十骑率先抵达南*京西门石城门外，忻城伯赵之龙、保国公朱国弼拿降表由城墙缒下，往清营洽谈投降事宜。

五月十五日，阿济格率清军主力抵达南京城外，赵之龙、朱国弼同魏国公徐久爵、隆平侯张拱日、大学士王铎、蔡奕琛、礼部尚书钱谦益、左都御史张霑等三十余名高官显贵大开城门，出迎于郊。

既然南*京方面主动投降，阿济格便大开杀戮，遂派兵入城搜索，勒令城内所有明军出城缴械。十七日，阿济格带兵入城，即把南京东、北两区汉民尽数驱逐出城，空下宅院供清兵居住，无数的百姓被从家中赶出，哭嚎着流离失所。

五月十八日，南*京被攻破的消息传到了扬州，满城大哗！

淮扬总督卫胤文等人哭嚎着面南而跪，连连以抢地。

“该生的事情终究会生，并不因自己的到来而改变啊！”任思齐喃喃自语道，说着谁也听不懂的话语。

“陛下，是臣等无能，对不起你呀！”苏醒过来的史可法强撑着跪在床上，连声痛哭。

南*京既然陷落，再守扬州已无任何意义，因为必然会遭到清兵的南北夹击，从扬州退兵再次提上日程。

可是扬州城内有兵六七万，百姓八十余万，想要安然撤退又谈何容易。

按照卫胤文等文官的想法，应该带领军队沿着运河直下长江，会同郑鸿魁的军队逃往杭州，在那里继续抵抗满清大军，至于扬州城内的百姓，则顾不了那么多了。

难得的是，史德威、胡尚友等武将也赞同众文官的看法，在他们看来，这些百姓全都是累赘。

可是任思齐却决意带着所有百姓转移，扬州抵抗多铎清军一个月，这一个月来，多达数万的清军死于扬州城下，若是抛下百姓而去，那么等待这八十万百姓的就只有无情的屠杀。

任思齐的固执引起了很多人的不满，就连李彦直也劝说任思齐放弃百姓轻装前进。

随后经过商议之后，任思齐和众文官武将达成了协议，由他们先行护送督师史可法沿着运河南下，而任思齐自己则带着宁波军及新募的六万新兵继续守城。

城中宁波系以外的绝大部分将领都选择了离开扬州，而总兵刘肇基和炮兵指挥陈于阶却选择留了下来。

五月十九日，史德威、马应魁、胡尚友诸将带着本部人马七千余人，护送着重伤未愈的督师史可法及众文官上了战船，沿着运河南下而去。